Новости химической науки > Меняющаяся протеаза спасает ВИЧ от действия лекарств

Ключом резистентности вируса ВИЧ к действию лекарств может быть подвижность «заслонок» молекулярной фильтрующей системы.

Расчеты демонстрируют возможные конформации протеазы ВИЧ-1 (молекулярные «заслонки» находятся вверху в центре); обычная конформация обозначена серым, резистентные к действию лекарства мутанты обозначены красным и синим. (Рисунок из J. Am. Chem. Soc., DOI: 10.1021/ja807531v)

Протеаза вируса ВИЧ-1 может мутировать, избегая воздействия лекарств, блокирующих ее активный центр, однако некоторые изменения происходят вне полости активного центра, суть этих изменений не вполне ясна. Чтобы понять, как эти мутации могут приводить к резистентности, исследователи под руководством Гэйла Фануччи (Gail E. Fanucci) из Университета Флориды решили скомбинировать результаты экспериментального исследования протеазы с помощью метода ЭПР и квантово-химических расчетов.

Ранее высказывались догадки о том, что мутации протеазы приводят к изменению подвижности двух молекулярных «задвижек» около активного центра молекулы. Для проверки этой гипотезы исследователи под руководством Фануччи использовали метод ЭПР для изучения того, как расстояние между «заслонками» влияет на резистентность протеазы ВИЧ-1 к действию лекарств. Комбинация данных ЭПР и расчетов позволила построить модель структурных изменений протеазы. Эта модель может быть использована для разработки новых типов лекарств.

Источник: J. Am. Chem. Soc., DOI: 10.1021/ja807531v

метки статьи: #биохимия, #квантовая химия, #медицинская химия, #молекулярная биология