Новости химической науки > В природной ДНК могут содержаться тиофосфорильные фрагменты

«Модифицированные» ДНК, длительное время рассматривавшиеся в качестве рабочего инструмента биохимиков и генных инженеров, встречаются в природе у некоторых видов бактерий.

Модификация, результатом которой является замещение одного из не-мостиковых атомов кислорода фосфорильного фрагмента, связывающего отдельные нуклеозиды (тиофосфорилирование) было первым известным способом физиологической модификации скелета ДНК.

Динуклеотид, встречающийся в геноме бактериальной ДНК, содержит атом серы вместо одного из не-мостиковых атомов кислорода фосфатной группы (Рисунок: Nature Chem. Biol., DOI: 10.1038/nchembio.2007.39)

Биохимик Питер Дедон (Peter C. Dedon) из Массачусетского Технологического Университета совместно с коллегами из Шанхайского Университета обнаружил такую особенность и в геноме бактерий. Хотя серу находили в составе нуклеиновых кислот и ранее, предыдущие примеры в, основном, касались молекул РНК и модификации гетероциклических азотистых оснований в их составе.

Молекулы ДНК с тиофосфорилированным фрагментом успешно получают и используют уже десятилетия, главным образом, благодаря тому, что тиофосфорильная группа обеспечивает стабильность полинуклеотидов по отношению к ферментам-нуклеазам. Это обстоятельство облегчает использование модифицированных молекул ДНК в биохимических исследованиях и клинических исследованиях. Пауль Шиммель (Paul R. Schimmel), профессор молекулярной биологии из Университета Скриппса отмечает, что то, что сделано человеком, возможно, ранее было уже сделано природой, а работа исследователей из MIT – яркое тому подтверждение.

Новые данные о серосодержащих молекулах ДНК получены в результате десятилетней работы, в результате которой было охарактеризовано пять ферментов, совместное действие которых приводит к включению атома серы в состав молекулы ДНК. Такой набор ферментов характерен для многих видов бактерий, но они не обнаруживаются в более высокоразвитых организмов.

Источник: Nature Chem. Biol., DOI: 10.1038/nchembio.2007.39

метки статьи: #биохимия, #молекулярная биология, #элементоорганическая химия