Новости химической науки > Наночастицы ДНК детектируют экспрессию генов

Исследователи из США получили наночастицы из ДНК, которые, по их словам, могут использоваться для определения экспрессии генов в единичной клетке.

Исследователи под руководством Хао Яна (Hao Yan) из Университета Аризоны уверены, что их наночастицы обладают рядом существенных преимуществ в сравнении с двумя известными методами анализа сложной смеси м-РНК, производимой активными генами.

Обычные микроустройства на основе ДНК отличаются медленной скоростью, работают лишь в том случае, если целевая молекула помечена флуоресцентным фрагментом и не могут быть масштабированы для анализа малых образцов.

«Наноплитки» пробы, полученные из свернутых одноцепочечных ДНК являются молекулярными аналогами макроскопических чипов на основе ДНК. «Наноплитки»могут улавливать свои целевые РНК в растворе, после чего могут быть адсорбированы на поверхности слюды и проанализированы с помощью атомной силовой микроскопии. (Рисунок из Science, 2008, 319, 180)

Новый метод позволяют непосредственно определять специфические молекулы с уникальной чувствительностью, поскольку для изготовления пробы используется единичная молекула ДНК, организованная в виде «наноплитки» и имеющая размеры 60 нм на 60 нм.

Наноплитки, представляющие собой пробы на строго определенные структуры РНК растворимы в воде и могут быть смешаны с изучаемым образцом так, что последовательности образуют гибрид ДНК/РНК. После образования гибриды адсоробируются на поверхности слюды, где они могут быть проанализированы с помощью атомной силовой микроскопии.

Исследователи из группы Хао испытали свою методику на трех типах молекул РНК из клеток мышей. В дальнейшем они планируют измерить пределы чувствительности своей методики. В намерения исследователей входит детектировать экспрессию гена в масштабах единичной клетки, а также для изучения кооперативного взаимодействия широкого круга биологических молекул.

Источник: Science, 2008, 319, 180 (DOI: 10.1126/science.1150082)

метки статьи: #биохимия, #молекулярная биология, #нанотехнологии